Knutsen hadde opprinnelig en kontrakt som strakte seg ut sesongen 2019.
Nå er den forlenget ut juni 2022, opplyste klubben på en pressekonferanse torsdag.
Også assistenttrener Morten Kalvenes har forlenget kontrakten.
Han var med å sjokkere foran 64.000 tilskuere. Nå håper Brann-spilleren på nytt Europa-eventyr.
– Vi føler vi er på vei til noe. Vi har fortsatt en vei å gå, men vi må utvikle oss. Det er et lagarbeid, sammen med en utrolig flott spillergruppe, som jobber hardt og er sulten på å bli bedre, sier Knutsen ifølge Eurosport.
Knutsen tok over som hovedtrener i januar i fjor og førte klubben til 11.-plass i eliteserien.
I årets sesong har Glimt overrasket og ligger på en foreløpig tredjeplass. Serieleder Molde ligger fire poeng foran med to kamper mer spilt.