Besiktas-spilleren sikret seieren med en spektakulær scoring like før slutt. 25-åringen tok med seg ballen på brystet omringet av tre Egypt-forsvarere, før han banket ballen i nettmaskene.
Søndagens oppgjør var tredje gang de to nasjonene har møtt hverandre i afrikamesterskapets finale. Egypt hadde vunnet begge de to foregående finalene, i 1986 og 2008.
Femte triumf
Egypt kom best i gang i årets finale da Arsenal-spiller Mohamed Elneny ga laget ledelsen midtveis i første omgang.
Samtidig som hans lagkamerater i Lyon spilte lokaloppgjør mot Saint-Étienne i Ligue 1, utlignet Nicolas N'Koulou for Kamerun like før timen var spilt, før Aboubakar ble matchvinner i det 88.-minutt.
Kamerun har vunnet Afrikamesterskapet fem ganger, senest i 2002. Egypt er turneringens mest suksessrike lag med sju titler.
(©NTB)