Det bekrefter Tottenham på sine hjemmesider fredag formiddag.
I januar ble Paratici utestengt i 2,5 år av Det italienske fotballforbundet (FIGC) etter at han ble funnet skylding i falsk regnskapsføring fra tiden som sportsdirektør i Juventus.
Den utestengelsen ble i slutten av mars gjort global av Det internasjonale fotballforbundet (FIFA). Paratici anket avgjørelsen, men siden den ble avslått skriver Tottenham at italieneren hindres fra å gjøre jobben som direktør i klubben.
Det førte til at 50-åringen valgte å trekke seg.
– Dette har vært en svært stressende tid for Fabio og hans familie, sier Tottenhams styreformann Daniel Levy, før han ønsker Paratici lykke til fremover.
Paratici ble ansatt som fotballdirektør i Tottenham i juni 2021. Forrige uke ble Scott Munn ansatt som fotballsjef i Premier League-klubben.